Trente-huitième campagne 2001/ 2002 :
Le 20 juillet 2001, le CV Philippe Combes passe le commandement de la Jeanne au CV Jérôme Régnier.
La Jeanne d’Arc est rentrée très fatiguée de son dernier tour du monde et retrouver une disponibilité suffisante prend plus de temps que prévu. Au mois d’octobre l’amiral Battet, chef d’état major de la Marine annonce «qu’il ne faut pas compter sur un bateau neuf pour remplacer la Jeanne».
Dans le même temps, au cours des essais en mer, une vibration anormale est détectée sur la ligne d’arbres tribord. Cela nécessite trois semaines pour remplacer un coussinet, ce qui oblige à décaler de 10 jours le départ de cette 38ème campagne et à annuler les escales programmées à Saint-Pierre et Miquelon ainsi qu’aux Bermudes.

Le groupe école, Jeanne d’Arc et Georges Leygues, quitte Brest le 30 novembre 2001 pour une campagne de 153 jours composée de 13 escales : Boston, Fort-de- France, Balboa, Callao de Lima, Valparaiso, Port Williams, Ushuaïa, Punta Arena, Bahia Blanca, Montevideo (conserve), Salvador de Bahia, Dakar, Tunis, Odessa, Alexandrie, La Valette et retour à Brest le 2 mai 2002. La Jeanne embarquera 2 hélicoptères Alouette III de la 22 S, 2 hélicoptères Puma de l’aviation légère de l’armée de terre et 2 hélicoptères Gazelle du 1er RHC.
A signaler :
- La Jeanne quitte Brest avec 100 m3 de fret humanitaire pour le Pérou victime d’un tremblement de terre.
- Cette campagne est marquée par le passage à l’euro le premier janvier 2002. Les marins ont quitté Brest avec des francs et reviendront avec des euros ! En France les particuliers ont reçu leurs premiers euros le 14 décembre mais la Jeanne est déjà en campagne depuis 15 jours. La Banque de France s’est montrée souple puisque la Jeanne et le Georges Leygues sont partis avec leurs lots d’euros.
- A Fort-de-France un marin est agressé avec une arme à feu et doit être rapatrié en métropole.
- Lors de cette campagne, évènement peu courant, le mythique cap Horn est franchi avec une mer d’huile.

- La traversée de Punta Arena à Montevideo est la dernière pour un marin particulier qui représente tout un pan de l’histoire du navire : l’aspirant Biget, dernier appelé de la Jeanne d’Arc, doit quitter le navire car il est arrivé au terme de ses 18 mois de service militaire.
- Malgré le professionnalisme du personnel que personne ne niera, les problèmes mécaniques reprennent à partir du Brésil et la traversée de Salvador de Bahia à Dakar se fait sur une seule ligne d’arbres.Une intervention sur les paliers de l’autre ligne d’arbres est réalisée à flots à Dakar par une équipe de plongeurs. Cette intervention, peu courante, permettra aux deux navires de repartir vers la Méditerranée puis la mer Noire.
2002 / 2003 : trente-neuvième campagne
Pour sa trente-neuvième campagne le PH se prépare à effectuer son 10ème tour du monde. Malheureusement, un bruit anormal est perçu lors des essais à la mer en fin d’épisode d’entretien

. Une intervention s’avère impérative car les lignes d’arbres qui relient les turbines à vapeur aux hélices sont en train d’user les paliers immergés qui les guident en rotation. Les travaux peuvent être effectués à flots mais le départ du groupe école est reporté du 4 au 12 décembre
2002. Du 26 décembre au 11 janvier, la Jeanne est en Martinique. Des contrôles effectués confirment le phénomène d’usure anormale des paliers de ligne d’arbre. Pendant ce temps, La conserve, le Georges Leygues, fait une escale officielle à Cuba du 26 décembre au 3 janvier. Le 11 janvier la Jeanne peut repartir avec un programme totalement revu. Le tour du monde prévu devient une campagne orientée sur la façade Ouest de l’Afrique avec comme escales, Fort de France, Port of Spain, Fortaleza, Dakar, Pointe Noire, Cotonou, Dakar, Casablanca, Naples, Carthagène, Toulon, Lisbonne et retour à Brest le 9 mai 2003.

Malgré toutes les péripéties, l’instruction bat son plein et les dernières traversées se font en Méditerranée, au sud de Toulon, afin de pouvoir bénéficier du concours de l’escadre varoise pour réaliser l’entraînement final des officiers élèves.
Le groupe école sera de retour à Brest avec dix jours « d’avance » après une dernière escale à Lisbonne, arrêt qui était inscrit au programme initial de la campagne.
